上述政府補助，在中央財政補助的基礎上，由國家扶貧開發工作重點縣(區)、省級扶貧開發工作重點縣(市、區)和基於西部大開發政策的縣(市、區)給予補助，省級標準為每戶3000元；其他壹般縣(市、區)，省級按每戶2000元的標準補助，由各地根據改造情況統籌安排。除了中央和省的補貼，其余政府補貼由市縣承擔。市縣財政應當將市縣農村危房改造補助資金納入財政預算。
各縣(市、區)要根據危房改造任務和補助資金發放總量，細化落實措施，合理安排鄉鎮危房改造任務，科學確定危房改造維修加固戶數。