個人所得稅房屋貸款扣除選擇申報方式如下：
1、扣繳義務人申報。優點是每個月都可以享受個稅專項扣除。缺點是單位負責申報，會涉及到個人隱私。
2、綜合所得年度自行申報。優點是保護個人隱私。缺點是沒有按月享受個稅專項扣除，需到第二年才能返還。
法律客觀：個人所得稅住房貸款扣除年限：個人所得稅專項附加扣除中住房貸款利息扣除期限最長不超過240個月。第十四條納稅人本人或者配偶單獨或者***同使用商業銀行或者住房公積金個人住房貸款為本人或者其配偶購買中國境內住房，發生的首套住房貸款利息支出，在實際發生貸款利息的年度，按照每月1000元的標準定額扣除，扣除期限最長不超過240個月。納稅人只能享受壹次首套住房貸款的利息扣除。本辦法所稱首套住房貸款是指購買住房享受首套住房貸款利率的住房貸款。舉例：小張2019年和妻子使用住房公積金購買了他們的第壹套房子，由於是首套住房，且使用了住房公積金，可以享受到住房貸款利息專項附加扣除，經過夫妻二人的商議，決定由小齊壹方扣除。小齊壹個月收入9000元，那麽按照《辦法》規定，小齊每月需納稅部分為：5000＋1000＝6000（元）；9000－6000＝3000（元）。溫馨提示：非首套住房不能享受該項專項附加扣除；壹個納稅年度內不得更換扣除方；辦理該項專項附加扣除需要留存住房貸款合同、貸款還款支出憑證。註意：5000元為月免征額。