1、交割標準不同：豆壹合約的交割標準是非轉基因大豆；豆二則包含全球各地的大豆，包括轉基因和非轉基因的。
2、可交割品範圍不同：黃大豆1號合約只允許非轉基因大豆參與交割；黃大豆2號期貨合約允許轉基因大豆和非轉基因大豆參與交割。