確認時，註冊會計師應向本年度在被審計單位有存款(包括對外存款、銀行匯票存款、銀行本票存款、信用卡存款和信用證存款)的所有銀行發函，包括公司存款賬戶已結清的銀行。因為有可能存款賬戶雖然已經結清，但是還有銀行貸款或者其他負債。
同時，雖然註冊會計師已經直接從壹家銀行取得了銀行對賬單和所有已付支票，但仍應向這家銀行出具確認函。
確認的方式:
確認的方式有兩種:肯定確認和否定確認。註冊會計師通過肯定函要求被調查人在所有情況下進行回復，以確認問詢函所列信息是否正確或填寫問詢函所要求的信息。通過否定函，註冊會計師只要求被調查人在不同意問詢函所列信息的情況下進行回復。