雖然臺灣也有支付寶，但是與大陸的支付寶不同，臺灣的支付寶是由臺灣的玉山銀行與支付寶合作推出的電子支付服務，名為「支付寶（臺灣）」。與大陸的支付寶相比，臺灣的支付寶在功能和使用上有所不同，例如臺灣的支付寶無法直接綁定銀行卡，需要通過玉山銀行的信用卡或借記卡進行充值和支付。
此外，臺灣的支付寶也沒有大陸支付寶的芝麻信用、螞蟻森林等特色功能。