2004年8月，國務院作出深化農村信用社改革的決定，雲南省農村信用社交由省政府管理。2005年3月28日，省政府成立了雲南省農村信用合作聯社(簡稱省信用社聯社)，承擔對全省農村信用社的管理、指導、協調和服務職能。全省農村信用社迎來了前所未有的改革發展機遇。雲南省農村信用合作聯社。
農村信用社的機構網點和業務網絡上至中心城市昆明，下至全省所有鄉鎮。在大多數鄉鎮和行政村，農村信用社是唯壹的金融機構。黨的十六屆五中全會提出“建設社會主義新農村是我國現代化進程中的重大歷史任務”。農業、農村和農民問題始終是全黨工作的重中之重。為實現“建設社會主義新農村”的宏偉目標，黨中央、國務院賦予農村信用社支農、惠農的重任，賦予了農村信用社重要的歷史使命，為其提供了廣闊的發展空間。