1965438+2007年8月，孫中山先生、孫、程璧光和唐決定南下護法。8月21日，他們率領海軍第壹艦隊（北洋水師主力艦隊）和參眾兩院部分議員出發南下。1年9月，在廣州召開了議會特別會議，孫中山當選為大元帥。孫中山先生聘請孫弘毅為高級顧問，並兼任內政部長。
與北洋軍相比，孫中山先生在廣州的軍事實力與北洋軍相差甚遠。而且西南地方勢力的合作基礎並不牢固，問題很多。孫建議先阻止北洋軍南下，從戰略上瓦解段的武裝統壹政策。由於北洋軍的將領大多來自北洋或直隸，而孫在直隸頗有威望，孫中山任命孫為長江大使，但當時並未對外宣布。作為孫中山的代表，孫和壹些工作人員回到上海，掌握輿論和出版工作..孫中山先生的重要言論被送往上海發表。孫在此期間工作異常努力，近百名編輯、印刷、出版人員和派往各地的聯絡人員頻繁往返匯報，研究對策。孫弘毅經常工作到深夜。
桃園派在上海積極開展平叛工作，但在廣州卻出現了問題。孫中山先生與西南各省組成的軍政府聯合，並試圖以“護國聯邦”取代軍政府，因為西南各省的將軍們服從楊而不服從尹。在非常國會中，中山學校的人民之友、西南地方軍政部隊政治部、吳敬璉和褚福成之友是非常國會的三大派系。乙酉部與政治學系壹起通過了改組軍政府的議案，以岑春煊取代孫中山，孫派因人員少而失敗。孫中山繞道回上海，然後孫派人陸續回上海。雖然孫中山先生的護法運動遭受挫折，但桃園派繼續通過各種渠道勸說直系服從孫中山的主張，維護盟約，抵制段的軍事行動。
1919五四愛國運動爆發，孫中山先生高度評價這場席卷全國的政治鬥爭。孫給北京政府的電報簡短地說:北京學生爭取外交主權，痛打漢奸，真正代表全國民意，有點熱血，應該懂得欣賞。北京政府的軍警善於逮捕愛國學生，袒護漢奸，並向渤海泄憤，希望下令釋放學生，懲處漢奸段、曹汝霖、、陸、徐樹錚，以擴大法律的適用範圍。並敦促巴黎特使拒絕巴黎和平條約。與此同時，孫發表《請北洋將領討賊救國》壹文，鼓動直接反對段。
1920年3月，孫利用直系與皖系的矛盾，派牟林、白建武鼓勵直系第三師師長吳從湖南衡陽返回北方。孫還與廣州軍政府聯系，答應給吳師60萬元行軍費。湖南省由譚顏楷接管，譚仙付給吳師傅40萬元。這壹舉動是由孫的調解促成的。武師相繼北上，7月6日，廣州軍政府宣布段政府擅自與日本簽訂軍事協定。隨後曹錕、張、王占元、陳光遠、李純、趙雅、蔡、馬福祥、王廷珍等向段軍宣戰。結果，安徽失敗，段下臺，總統徐世昌避津，安福和安徽將領相繼辭職。
同年，5438年6月+10月粵軍攻克廣州，莫榮信被迫取消獨立，岑春煊和陸榮廷聯名罷免軍政府。65438年10月29日，孫中山先生從上海回到廣州，改組軍政府，並向全世界宣布這是中華民國的合法政府。1921年4月6日，非常國會召開，桃園派周震林提出《中華民國組織法大綱》。然後丁偉提議繼續二讀會議（根據:二讀會議是立法的第二個程序，分為壹次閱讀會議，即在議會閱讀提案；二讀書會上，大聲宣讀采納理由；將進行三讀，並適時宣讀決議，然後結案）。最後，決議壹致選舉孫中山先生為大總統。同年4月27日，北洋政府曹錕等33人聯名反對選舉孫中山為總統，遭到廣州國民大會的駁斥。10年8月，孫中山宣布徐世昌有罪，決定組織北伐大軍開始北伐。在1922年北伐軍節節勝利之際，由於陳炯明的叛變，孫中山先生被迫乘坐英國輪船前往香港，然後於14年8月返回上海，護法戰爭轉入另壹個階段。