2003年，全區實現國內生產總值50.9億元，比1988年增加44.28億元，增長4.71倍（可比價計算）。1988-2003年，全區國內生產總值年均增長12.3%（幾何平均法計算）。
1988-1990年為區內經濟起步時期，1988年實現國內生產總值6.62億元，比1987年增長39.2%，1990年實現國內生產總值8.32億元，比1989年增長8.9%，“七五”（第七個五年計劃，下同）期間後三年國內生產總值年均遞增20.2%。“八五”期間，國內生產總值受固定資產投資拉動影響，年均遞增22.5%，但增幅起伏較大，其中1993年增幅達到歷史最高點，比上年增長46.1%。1995年，實現國內生產總值34.21億元，比1994年增長24.4%。
1996-2003年為區內經濟穩步增長時期，全區已形成門類較為齊全，以電線電纜、建材陶瓷、制衣、電子、鋁材、銅材、塑料制品等為支柱產業的工業體系，商業、飲食業、房地產業迅速發展，生產總值中，各個產業之間的比重發生變化，打破了以農業、商業、飲食業為經濟主體的歷史格局，工業、建築業所占比重擴大。2000年全區實現國內生產總值37.82億元，比1999年增長9.2%，“九五”期間國內生產總值年均遞增3.8%，2003年實現國內生產總值50.9億元，比2002年增長21.4%，“十五”期間前三年國內生產總值年均遞增11.3%。
2011年上半年，清城區全區實現生產總值158.5億元，增長18.5%，經濟保持快速發展，運行質量明顯提升。工業發展提質增量。新增規模以上工業企業23家，達到140家；完成規模以上工業產值582.5億元，增長92%；完成規模以上工業增加值76.5億元，增長40.1%。企業利潤高速增長。實現規模以上工業企業利潤總額6.67億元，增長3.78倍。財稅收入大幅增加。完成地方財政壹般預算收入5.72億元，增長58.6%。在全市主要經濟指標排名中，清城區取得了生產總值、規模以上工業產值、規模以上工業增加值、社會消費品零售總額、全社會固定資產投資、農民人均現金收入六項指標總量第壹和生產總值、規模以上工業產值、規模以上工業增加值、社會消費品零售總額、全社會固定資產投資五項指標增速第壹的好成績。 清城區所轄鄉鎮曾是廣東省和原清遠縣的主要糧產區之壹。1988年，撤縣建市設區之後，農業仍然為區內的基礎產業。至2003年，在城市面積不斷擴大、農田面積逐漸減少的情況下，區委、區政府調整全區農業產業結構和農業生產布局，改革農業生產方式，興修農田水利，推廣農業技術，提高水稻產量，發展高產、高質、高效的城郊型農業，在保證糧食生產的前提下，發展蔬菜、水果、花卉等經濟作物，農業生產逐步由傳統自給農業向現代商品農業轉變，全區農業總產值13.13億元，為1988年的4.58倍。
壹、傳統農業
水稻種植業是本區的傳統農業，有優越的自然條件和豐富的種植經驗，種植出來的大米質優價廉，市場需求量大。傳統水稻種植業有以下幾個特點：種植規模小；商品率低；機械化水平低；水利工程量大等特點。
大部分年青的富余勞力紛紛“洗腳上田”，到發達的珠江三角洲務工，在家鄉守著“壹畝三分地”的大多是老人和小孩，土地丟荒現象較為嚴重。
二、特色農業
清城區現有耕地25.7萬畝，山地面積3.7萬公頃。農產品以水稻為主，是廣東省重點產糧區之壹，也盛產花生、甘蔗、蔬菜、水果、筍、藥材、食用菌等經濟作物。區內畜牧水產資源豐富，清遠麻黃雞、烏鬃鵝馳名中外，其中馳名省港澳的清遠雞年產量達500萬只以上。生豬和水產品產量較大，是珠三角鮮活農副產品生產基地，乳鴿、花雀、瘦肉型豬和桂花魚、加州鱸魚等產量可觀。清城區農業的亮點:品牌農業、綠色農業、生態農業、信息農業、效益農業。
三、生態農業
生態農業：以生態經濟系統原理為指導建立起來的資源、環境、效率、效益兼顧的綜合性農業生產體系。如稻田養魚、養萍，林糧、林果、林藥間作的主體農業模式，農、林、牧結合，糧、桑、漁結合，種、養、加結合等復合生態系統模式，雞糞餵豬、豬糞餵魚等有機廢物多級綜合利用的模式。
2008年，該區農業農村經濟繼續平穩較快發展，全年實現農業總產值19.96億元，比上壹年增長7.4%。其中種植業8.08億元，增長13.62%；牧業9.4億元，增長11.46%；漁業1.95億元，增長15.15%。農民人均年純收入6198元，增長14.9%，創下近年來最高增幅。全區全年農作物播種面積46.38萬畝，同比增2.2萬畝，增長4.9%；其中糧食面積27.5萬畝，總產8.4萬噸，分別增2.2%和18.3%；蔬菜面積12萬畝，產量17.3萬噸，增長7.4%；生豬出欄量23.7頭，增加0.81萬頭，增長3.5%；三鳥出欄量1447.36萬只，增加146.18萬只，增長11.23%；淡水養殖面積5.6萬畝，水產品產量2.65萬噸，增長6%，產值2.76億元，增長6%。禽畜水產養殖業繼續成為我區農業生產的主導產業。 清城區所轄行政區劃曾是廣東省和原清遠縣的主要糧產區及“三鳥”（雞、鵝、鴨的簡稱）產區之壹，經濟收入以農業為主，工業生產底子薄弱。
建區後，區、鎮（街、場）二級黨委、政府（辦事處、場部）確立“工業立區、工業強區”的指導思想，建立和健全工業管理、服務機構，深入開展工業企業管理體制改革，加大招商引資工作力度，扶持和發展非公有制企業，全區工業生產結構和工業所有制結構發生了較大的變化，形成了以電線電纜、建材陶瓷、制衣、電子、鋁材、銅材、塑料制品等為支柱產業、非公有制企業為主體的工業生產體系。2003年，全區工業企業有2206家，其中規模以上的工業企業有29家。實現工業總產值27.35億元，是1988年2.08億元的13倍多。工業成為區內國民生產的主要產業。
清城區憑借優越的區位條件，強大的資源優勢。傾力打造洲心工業園、荷興工業園、泰洋湖工業園、建材陶瓷工業城、金沙灘工業小區、泰基工業小區、雄興工業小區、循環經濟產業園、清遠市毅力工業城、清遠市科技工業城等多個傑出的工業園區，積極地帶動了城區經濟的持續快速健康發展。清城區經濟運行良好。工業逐漸變成清城區經濟的主體，尤以輕工業為發達，初步形成電線電纜、陶瓷、醫藥、電子、建材、塑料、制衣等支柱產業。規模工業生產總量和增長速度躍居全市首位；支柱產業成為該區工業發展的主要推動力；“三資”企業工業增勢強勁，成為該區工業經濟高速發展的支撐點。 1988年，區內有學宮、渠坑口、下廓、北門、洲心、源潭、高橋、龍塘、石角、興仁、界牌和城中路工業品等12個市場，建築面積***3.24萬平方米。
1991年，根據市政府《關於加快集貿市場發展的若幹規定》精神，區、鎮二級政府從市場用地、貸款、報建等方面提供優惠政策，加快農貿、集貿市場建設的步伐。農貿、集貿市場實行建設與管理相結合，由工商行政部門投資建設和管理。從1995年開始，依據國務院辦公廳《關於抓緊做好市場辦管脫鉤工作的通知》，農貿、集貿市場建設實行辦、管脫鉤，由社會投資建設，呈現多形式投資、多元化建設的局面。
1989-2003年，相繼建成的農貿市場和集貿市場分別為：南埗市場、橋北綜合批發市場、松崗市場、新城中心市場、平安市場、白馬塱市場、下濠基市場、和順市場、銀洲市場、下廓市場、附城市場、先鋒市場、花廳市場、蓮塘市場、西門市場、昌記市場、城南市場、附城綜合市場、三角肉菜市場、名都肉菜市場、百嘉市場、銀盞市場、橋北水果批發市場，市場建築面積***8萬平方米。截至2003年底，區內有農貿、集貿市場36個，建築面積***11.24萬平方米。